纽约市下水道，四只小海龟和一只小老鼠由于接触什么？你不能答应？卫凤瑶不敢相信地瞪着陈源，卫剑雄暗暗摇头，卫剑英脸上的微笑收了起来，右手开始旋转左手拇指上的玉扳指，卫凤娇眉头微皱，原本给陈源的温柔笑容冷了下去，脸色渐渐变得铁青。了含有放射性物质的凝胶而变异为巨大的人化生物。暴躁冲动却富有激清的拉斐尔（乔什·帕斯 Josh Pais饰），幽默风趣的的米开朗基罗（迈克林·西提 Michelan Sisti饰），个性沉稳的多纳泰罗（雷夫·提勒顿 Leif Tilden饰）以及他们的领导者达芬奇（大卫·福尔曼 David Forman饰），这四只功夫高强的忍者龟便肩负起为纽约市除暴安良的神圣使命。他们神勇无比、所向匹敌，在多次行侠仗义后，与城市里的一个神秘组织结怨。神秘组织展开一次突袭，由于寡不敌众，忍者神龟受了重伤，同时，他们的老师也被这个神秘组织抓去。
